مبارزه با یهود و القائات سوء آنها در فرهنگ اسلام، بخش مهمی از برنامه کاری ائمه(علیهالسلام) به خصوص امام باقر(علیهالسلام) را به خود اختصاص داده بود.
شهادت امام باقر
ارائه معجزه از سوی حضرات معصومین (علیهمالسلام) یک سنت الهی است و برای هدایت مردم بوده است. البته ایشان از معجزه بهعنوان یک سیاست تبلیغی دائم بهره نمیگرفتند لکن در برخی از اوقات و با توجه به شرایط خاصی از آن استفاده میکردند.
امام باقر(علیهالسلام) در زمان امامت با استفاده از روشهای علمی و سودمند به تبلیغ اسلام پرداختند که یکی از این روشها؛ مناظره و گفتگو با بزرگان فرقههای دیگر بود که مهمترین ثمره آن تبیین صحیح اسلام راستین و حقیقی توسط امام باقر(علیهالسلام) بود.
جانشینان امت من دوازده نفرند و همگی آنان از قریشند؛ ایشان در زمان خود توانست علوم الهی را گسترش دهد، فلذا از این جهت او را باقر العلوم یعنی شکافندهی علم مینامند.
مام باقر (علیه السّلام) تصویری واقعی از اخلاقیات مورد تاکید قرآن و الگوی درخشان از اخلاق اسلامی برای هدایت انسانهاست، فضائل اخلاقِ اجتماعی، عبادی و فردی حضرت آن چنان والاست
مجموعه سخنرانی های مکتوب ویژه شهادت امام محمد باقر علیه السلام کاری از پایگاه اطلاع رسانی بلاغ
از جمله تلاشهاى گسترده امام در این عرصه تبیین شیوه هاى صحیح استنباط حکم شرعى از منابع دینى بود که بیش از پیش به اعتلا و توانمندى فقه شیعه غنا بخشید.
امام بهسان خورشیدى گیتى فروز، بر سپهر دانش پرتو افکن بود و در بیان برترى و بزرگى این جایگاه، همین بس که بیشترین حدیث در بین جوامع حدیثى شیعه، از آن امام همام و فرزند برومند و خردمندش امام صادق(ع) است
در مورد ایجاد جنبش عظیم علمى امام، همین قدر کافى است که بدانیم امام باقر علیه السلام و فرزندش امام صادق علیه السلام در سایه بحرانهاى درونى نظام اموى که آنها را مشغول خود ساخته بود، به تاسیس حوزه هاى بزرگ درسى و علمى موفق شدند
از آنجا که عصر امام باقر علیه السلام، روزگار برخورد اندیشه هاى اسلامى و غیر اسلامى بود، مناظرات زیادى بین دانشمندان ادیان مختلف با امام از سوى دربار سازمان دهى شد و آخرین حکمرانان بنىامیه این سیاست کهنه و شکست خورده را بار دیگر از سر گرفتند.